1985年，我國引進了第一條果凍生產線，產品一經面市就以其獨特的口感，濃郁的果香味以及新穎的包裝形式贏得了廣大消費者，尤其是少年兒童的青睞。十五年來，經過廣大廠家的辛勤開拓，果凍已在全國城鄉家喻戶曉，成為年產過百億元的大宗商品。但是，隨著人民生活水平的提高，人們對果凍的要求越來越高；但是，果凍的菌落總數、大腸桿菌超標問題時常發生，嚴重影響了果凍的衛生質量。
專業從事食品殺菌消毒技術研究和設備開發的上海康久消毒技術有限有限公司市場部孟偉洪經理認為，采用衛生質量良好的原料及科學的加工工藝、使用動態連續殺菌技術和動態空氣消毒機，則可有效控制微生物對果凍食品的二次污染、提高食品衛生質量。
按照GB 19299-2003《果凍衛生標準》規定：果凍菌落總數≤100cfu/g、大腸菌群限量指標≤30MPN/100g，霉菌≤20cfu/g，酵母≤20cfu/g；其中沙門氏菌、志賀氏菌、金黃色葡萄菌等不得檢出。其加工流程為：原料混合—煮膠—調配－灌裝、封口－殺菌－冷卻－包裝－成品－上市銷售，經過一系列加工步驟，如何保證果凍微生物不超標？
據上海康久消毒技術公司孟偉洪經理介紹：食品污染受制于內源污染，即原料本身所攜帶的微生物；外源污染，又稱二次污染或交叉污染，指生產器具、生產環境、人員、包裝材料等給產品造成的污染。隨著《新食品安全法》的正式實施后，內源污染基本可以做到制度規范、流程可防可控；但外源污染，目前很多沒有掌握其中的要點。
果凍行業問題及解決辦法：
1、近年來果凍明膠事件，果凍噎死孩子的事件不斷曝光，果凍本身的安全性越來越被人們所懷疑。由此看出，果凍的食用方法急需改良。
2、果凍的產品原料和營養價值不被大眾熟知，廣大消費者卻認為果凍是由明膠、防腐劑、色素及糖精做成的不健康、不安全的食品。果凍企業需要投入大量廣告向消費者宣傳果凍的生產原料、生產工藝、及卡拉膠的營養價值等。
3、果凍產品跟風嚴重，產品創新及營銷創新不足，多數企業沒有自己的特色主打產品。目前市場上的很多果凍，不同的品牌的果凍種類都差不多，從口味，包裝，甚至名稱都大同小異。相同的果凍造型、果凍上面類似的圖案幾乎都有一個水果、幾乎相同的單品名稱。
4、很多消費者認為吃果凍很費勁，不容易撕開果凍的封口。需要借助剪刀來剪刀開封口。另外果凍的汁液容易濺出來并將手弄臟。這也同時涉及到果凍的食用方法及包裝的改良問題。
5、果凍產品一開始都是針對兒童的，導致品牌名稱都往兒童身上靠，喜之郎、金娃、蠟筆小新等，都明顯帶有兒童食品的品牌痕跡。
6、小部分品牌的果凍食品菌落總數存在超標現象，主要是缺乏衛生意識，環境及設備清潔沒有標準、沒有公示、沒有培訓、沒有獎懲，往往過于形式只要產量達標、面子上過得去即可，導致機器內的微生物過多；果凍加工廠的車間密封性不好，墻壁、屋頂布滿灰塵，車間內的空氣含很多微生物，機器自動包裝時遭受了空氣中微生物的污染（即二次污染）。
針對以上問題，可以采用動態消毒技術。何為動態消毒技術呢？一種人機同場作業的消毒方式：針對空氣消毒時人員無需離開消毒場所，即在有人工作情況下殺滅空氣的細菌，不存在任何的副作用。消毒過程為：在工人上班的時候開機，中午工人吃飯休息時持續開機，在工人下班的時候關機，整個過程就是一個動態消毒的過程。因此，此種消毒方式稱之為NICOLER動態殺菌技術。
據悉，上海康久消毒技術有限公司所研發的動態空氣消毒機——這是國內第一個真正意義上的食品企業專用的動態消毒設備。為克服食品車間高溫、高濕及高異味等特點，該設備采用最新的NICOLER三級雙向的等離子體滅菌腔工作原理，消毒過程為：通過高壓直流脈沖使得等離子滅菌腔產生逆電效應，生成大量的等離子體（滅菌因子）。在負壓風機的作用下，空氣中污染空氣被抽進機內通過等離子滅菌腔時，帶負電細菌被迅速分解滅殺，整個的殺菌過程就0.1秒，使受控環境保持在“無菌無塵”標準。
目前，該動態消毒技術已在泉州、上海、南京、溫州等地的4000多家食品企業應用，應用的食品包括肉制品、糕點、飲料等，并取得了良好的殺菌效果。該公司孟偉洪經理表示：為了與更多的果凍生產企業交流，可免費設計平面圖紙及編制技術方案；采取采取多種營銷措施，向更多的果凍企業提供這種性能優越的殺菌消毒設備和應用技術，保障食品安全，助果凍遠離微生物二次污染。